تبلغ مخصصات رئاسة الجمهورية المصرية في الموازنة العامة للعام المالي الحالي 2012 / 2013 نحو 291 مليون جنيه (34 مليون دينار) كمخصصات لمؤسسة رئاسة الجمهورية، بارتفاع سجل زيادة بلغت 30.4 مليون جنيه (3.55 مليون دينار) عن العام السابق الذي شهد الثورة.
ويتقاضى رئيس الجمهورية ( محمد مرسي ) راتبا كموظف ، إضافة إلى المكافآت والحوافز والبدلات الخاصة بالمنصب ، ولا يجوز لرئيس الجمهورية أن يتقاضى أي مرتب أو مكافأة أخرى.
ووفقا لوكيل سابق بالجهاز المركزي للمحاسبات فإن الرئيس بخلاف العلاوات ، يتقاضى بدل التمثيل (تمثيل الدولة) وهو ما يضاف إلى الراتب الشهري بواقع 2000 جنيه (233 دينارا)، ومن ثم يصبح الراتب الشهري للرئيس 8 آلاف جنيه، (934 دينارا) إضافة إلى أن الرئيس يتقاضى نقدا من مخصصات الرئاسة أو من بند الأجور في الموازنة العامة، بدلا عن كل الإجتماعات التي يعقدها، إلى جانب بدل إنتقال عن كل تحركاته، سواء الرحلات الداخلية أو الخارجية ، وهي مدفوعة بنسبة 100 بالمئة من ميزانية الدولة، وذلك بواقع ثلث تكلفة السفرية، كمصروف جيب، أي أن راتب الرئيس الجديد لا يتجاوز 10 آلاف جنيه (1168 دينارا).
يشار الى ان راتب رئيس الجمهورية المصرية قبل الثورة كان غير محدد وغير معلوم، نظرا إلى عدم وجود حد أقصى للأجور في ذلك الوقت.
